“开拓者号”带着星核之源赋予的金色光带，在银河中缓缓航校这段时间，他们按照“银河生命图谱”，先后前往十颗生态受损的星球——在光羽族的治愈之光、绿族的生命能量与水族的洋流配合下，枯萎的植被重新发芽，污染的水源恢复清澈，濒危的星际生物也逐渐恢复生机。
当舰船停靠在“荒芜星”进行生态修复时，云航掌心的守护者印记突然剧烈发烫，金色光带也开始闪烁不定。莉娅的星感能力瞬间绷紧，她闭眼感知片刻，脸色骤变：“是星核之源的‘本源回响’！它在警示我们——混沌本源要苏醒了！”
众人立刻返回“开拓者号”，苏芮调出银河全域能量监测图，发现银河边缘的“混沌星域”正释放出微弱的黑色能量波动，这些波动与当年的黑暗星核能量同源，却更加诡异、更具侵蚀性：“混沌星域的空间正在扭曲，像是有什么东西要冲破束缚！”
老周立刻联系银河文明共同体的所有成员：“机械族，麻烦扫描混沌星域的空间结构；水族，用洋流监测能量扩散速度；光羽族，准备治愈之力，防止混沌能量侵蚀周边星球！”
监护者01的机械语音很快传来：“扫描完成！混沌星域中心有一处‘混沌裂隙’，裂隙深处有巨大的能量体，正是混沌本源！它的苏醒速度比预期快十倍，预计三后就会冲破裂隙！”
洋流长老也发来紧急讯息：“混沌能量正在顺着星际洋流扩散，已经影响到三颗边缘星球，上面的生物开始出现狂暴现象！”
云航看着监测图上不断扩大的黑色区域，深吸一口气：“所有人立刻行动！陈峰，带领战机编队在混沌星域外围建立防线，阻止混沌能量扩散；莉娅，联合绿族与光羽族，在受影响星球建立‘生命屏障’；老周，用机械族的技术加固星核节点，将星核能量集中到混沌裂隙，准备封印！”
“开拓者号”全速驶向混沌星域，途中，银河各文明的支援陆续抵达——机械族的工程舰在快速搭建能量屏障，水族的洋流舰在引导洋流改变方向，冰封族的战舰释放低温能量，暂时冻结混沌能量的扩散，绿族与光羽族的成员则在受损星球上救治生灵。
当“开拓者号”抵达混沌星域时，混沌裂隙已扩大到数十公里，黑色的混沌能量不断涌出，裂隙周围的星空被染成一片漆黑。云航举起手中的守护者印记，金色的本源之光瞬间爆发，与星核节点的能量汇聚成一道巨大的光柱，朝着混沌裂隙射去。
“所有文明，将能量注入光柱！”云航的声音通过通讯器传遍整个银河。瞬间，绿族的生命能量、机械族的技术能量、水族的洋流能量、光羽族的治愈能量……无数道不同颜色的能量束从银河各处汇聚而来，融入金色光柱。
光柱击中混沌裂隙，黑色能量被暂时压制。但裂隙深处，混沌本源发出一声震耳欲聋的嘶吼，一股更强大的黑色能量爆发，将光柱节节逼退。云航的身体开始颤抖，本源之光的光芒也逐渐暗淡：“坚持住！我们不能让银河回到黑暗时代！”
就在这时，星核之源的金色光带突然分裂，化为无数道细的光羽，融入银河每一个文明成员的体内。无论是岩族的孩子、冰封族的战士，还是机械族的机械体，都感受到一股强大的力量在体内苏醒——这是星核之源赋予所有和平文明的信念之力。
“为了银河的和平！”无数道声音同时响起，更多的能量涌入光柱。金色光柱瞬间暴涨，彻底压制住混沌能量，朝着混沌裂隙深处射去。混沌本源发出一声不甘的嘶吼，最终被光柱封印在裂隙深处，混沌裂隙也缓缓闭合。
当一切恢复平静时，云航看着周围前来支援的各文明舰船，眼中满是欣慰。监护者01的显示屏上浮现出笑脸：“混沌本源被成功封印，银河的和平得以延续。”
云航点点头，望向璀璨的星空：“这不是结束，而是我们共同守护银河的新开始。只要所有文明携手同行，就没有战胜不聊危机。”
“开拓者号”的引擎再次轰鸣，金色光带重新环绕在舰体周围。
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