RAdVt南美分部的警报声被雨林的蝉鸣吞没。监控屏幕上，马瑙斯附近的亚马逊河支流正泛起翡翠色的泡沫，河水在河岸两侧的树干间游走，形成网状的绿色脉络——生物探测器显示，水中漂浮着一种未知的藻类孢子，它们能在30秒内侵入动植物细胞，使其发生翡翠化变异，一只成年美洲豹的尸体在镜头前逐渐硬化，最终变成覆盖着藻类的翡翠雕像，瞳孔处还留着生前的惊恐。
新玉恭子的红隼3号悬停在树冠层上空时，旋翼卷起的气流吹散了部分瘴气。她盯着平视显示器，河流交汇处的水面突然隆起，形成一个直径约五十米的翡翠色水 dome（穹顶）， dome 表面的藻类在阳光下闪烁，像无数细的绿宝石。更诡异的是 dome 中心的“翡翠之心”，那团拳头大的绿色凝胶正规律地脉动，每跳动一次，周围的藻类就会向外扩张三米，所过之处，木质的码头在绿色泡沫中软化，最终化作滋养藻类的腐殖质。
“美奈，β机用火焰喷射器清理河岸的藻类！”她猛地推节流阀，战机在巨树的气生根之间做了个惊险的桶滚，避开一团从水面跃起的翡翠泡沫，机翼上瞬间滋生出细密的绿斑，“这些孢子怕高温，400度能让它们的细胞膜破裂！”
香椎美奈的红隼2号β机立刻俯冲，主翼下的火焰喷射器“呼呼”喷出橘红色火舌。被灼烧的藻类发出刺鼻的气味，翡翠色的躯体蜷缩成焦黑的团块，但更多的孢子从 dome 中涌出，它们像有智慧般绕开火墙，顺着树干的裂缝向上攀爬，将望树的树冠染成一片翠绿，叶片在变异后变得像翡翠一样坚硬，边缘锋利如刀。
“它们在利用植物的输导组织扩散！”美奈的声音带着惊惶，β机的起落架被翡翠泡沫溅到，轮轴瞬间被绿色凝胶包裹，“晴子，用除草剂炸弹攻击水面！含铜离子的药剂能抑制孢子分裂！”
松木晴子的红隼2号a机如离弦之箭般掠过河面，箱式除草剂炸弹“轰”地炸开，绿色的药剂在水面形成泡沫屏障。翡翠孢子在接触铜离子后明显停滞，但 dome 中心的翡翠之心突然加速脉动，河底的淤泥中冒出无数白色的根须，它们缠绕成巨型的海绵状结构，将药剂吸收转化为滋养藻类的养分，屏障在三分钟内彻底瓦解。
新玉恭子的目光突然被雨林深处的黑水潭吸引。那里的水面漂浮着一层黑色的腐殖质，翡翠孢子在接近潭水时明显减速，绿色的躯体甚至出现了轻微的白化——当地土着曾，黑水潭的水中含有某种特殊的单宁酸，能让任何外来生物失去活性。
“晴子，用破甲弹炸开黑水潭的堤坝！”她对着通讯器嘶吼，红隼3号突然俯冲，激光炮“嗞”地射向潭边的岩石，“单宁酸能破坏孢子的细胞壁，我们必须让黑水注入主流！”
红隼2号a机的破甲弹“咻”地射向堤坝，爆炸的冲击波撕开十米宽的缺口，黑色的潭水裹挟着腐殖质奔涌而出，如墨色的巨龙扑向翡翠色的河面。两种水体交汇的瞬间，绿色的藻类开始剧烈收缩，翡翠色的泡沫在黑色的潭水中化作白色的絮状物，像被中和的毒素。
“就是现在！”新玉恭子将战机的反重力引擎调至最大功率，红隼3号在水面上掀起强烈的气流，将黑水推向 dome 中心，“美奈，同步启动所有激光武器，瞄准翡翠之心！”
三道激光束在黑色的水面上交汇，精准命中那团绿色的凝胶。翡翠之心在强光中炸开，释放出的孢子在接触黑水后迅速失活，化作无害的白色粉末沉入河底。巨型水 dome 失去能量支撑，在“咔嚓”声中崩解，翡翠色的河水逐渐恢复清澈，只有被变异的树木还保持着翠绿的颜色，像一座座然的翡翠雕塑。
当红隼3号降落在土着村落的空地上时，雨林的夜幕已经降临。新玉恭子跳下来，看着巫医用黑水潭的泥浆涂抹村民被孢子感染的皮肤，绿色的斑块在黑色的泥浆中渐渐消退，露出健康的古铜色。香椎美奈递过来一碗用巴西莓熬制的浓汤，陶碗在篝火中泛着红光，远处的河面上，萤火虫在恢复清澈的水面上飞舞，像无数流动的星辰。
“技术部检测到翡翠孢子的基因序列，与三亿年前的史前藻类高度相似。”森田悟的全息投影出现在吊脚楼的栏杆上，被火光映得忽明忽暗，“它们是地球原生的极端环境生物，只是被近期的地质活动唤醒，算是场跨越亿年的苏醒。”
新玉恭子抚摸着一棵被翡翠化的树干，表面的绿色晶体在火光中折射出奇异的光芒。她突然想起土着长老的话：雨林的河流像大地的血脉，既会带来生命，也会带走腐朽。那些被永久翡翠化的树木，或许会成为未来的化石，向后人诉这场绿色的脉动曾如何掠过亚马逊的心脏。
“我们去吃亚马逊烤鱼吧。”她对着美奈和晴子笑了笑，河岸边传来土着的歌声，古老的旋律在雨林中回荡，与红隼战机的引擎余韵交织成奇妙的和弦。三架战机并排停在空地上，机翼上的绿斑在夜露中渐渐褪去，只留下几处淡绿色的痕迹，像雨林给勇敢者的勋章。
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